Kısa zincirli yağ asitleri (KZYA) prebiyotiklerin bağırsak mikrobik fermantasyonu, özellikle sindirilmemiş diyet karbonhidratları, dirençli nişastalar ve diyet lifleri tarafından üretilen organik asitlerdir. Temel olarak, KZYA’lar mikrobiyotanın metabolik etkilerinin ve besin kaynakları ile etkileşimlerinin ürünleridir. KZYA seviyeleri obezite ve diyabet ile yakından ilişkilidir: Bağırsak mikrobiyota obeziteyi ve tip 1 ve tip 2 diyabetes mellitus (T1D ve T2D) gelişimini açıkça etkilediği görülmektedir. Asetat, propionat ve bütirat-sistemimizdeki en bol bulunan KZYA’lar-bağırsak mikrobiyotası tarafından kabaca 3:1:1 oranında üretilir. Çoğu doğrudan kolonositlerde metabolize edilir; geri kalanı karaciğer, kas, böbrek, beyin ve kalbe enerji sağlayan hepatik portal dolaşımına emilir. Bağırsak epiteline emilen asetat, asetil CoA’ya dönüştürüldükten sonra trikarboksilik asit (TCA) döngüsüne (sitrik asit döngüsü veya Krebs döngüsü olarak da bilinir) girer ve ATP, kolesterol ve yağ asitleri üretir. Propionat, karaciğere ulaşmadan önce bağırsakta glukoneogenez için bir substrattır. Bağırsak epitelinden de novo sentezlenmiş glikoz, portal venden kaynaklanan bağırsak-beyin nöral devresi tarafından algılanır ve bu da insülin duyarlılığını ve glukoz toleransını artırır.